Damit Blöcke die ein Avalon Interface besitzen einfach miteinander Verbunden werden können stellt Altera ein Programm Namens Qsys zur Verfügung. Bei Qsys handelt es sich um einen Nachfolger von SOPC-Builder. Dieser sollte jedoch nicht mehr eingesetzt werden, da er nicht mehr weiterentwickelt wird und auch bei der neusten Quartus Version nicht mehr mit ausgeliefert wird.
Ein Beispiel wie Qsys verwendet werden kann findet man hier am Beispiel eines GPIO Interface, dass an einen PCI Express Block angeschlossen wird.